Blick da langsam nicht mehr durch, erst soll der Mod weg, weil er inkompatibel ist, was auch für einer, dann soll er auf einmal laufen, also was ist nun... Wenn du nicht sagst was für ein Mod und nicht mal ein paar Logs anhängst, kann man auch nix machen!
Es ist doch alles da, man muss nur mal danach suchen, wenn man es nicht findet, kann man es einfach mal so formulieren, dass man sofort versteht, was du nun genau willst.
Mods kommen in den Ordner mods, dann je nach dem, was es für einer ist, in den passenden Unterordner. Dann eine Verknüpfung der warzone2100.exe anlegen, den Befehlszeilenpararmeter anhängen, über diese Verknüpfung starten und fertig.